เมื่อวันที่ 21-22 มิถุนายน 2555 คณะเภสัชศาสตร์ ได้เข้ารับการตรวจประเมินคุณภาพการศึกษาภายใน ปีการศึกษา 2554 โดยได้รับเกียรติจากคณะกรรมการตรวจประเมินคุณภาพการศึกษาภายในจากหน่วยงานภายนอกและภายในมหาวิทยาลัยซึ่งประกอบด้วย ผศ.ดร.อัญชลี ตัตตะวะศาสตร์ คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น ประธานคณะกรรมการฯ ผศ.ดร.ปราณี พัฒนพิพิธไพศาล ผศ.ดร.นลิน เพียรทอง ดร.สมศรี ชัยวณิชยา อ.กุลธารา มหาดิลกรัตน์ อ.ศิริสุดา แสนอิว และนายรัฐพล แม่นธนู (เลขาฯ) ซึ่งในปีการศึกษา 2554 คณะกรรมการตรวจประเมินฯ ได้พิจารณาผลการดำเนินงานจากเอกสารหลักฐานต่าง ๆ รวมถึงการสัมภาษณ์นักศึกษา ผู้บริหาร คณาจารย์ บุคลากรสายสนับสนุน ผู้ใช้บัณฑิต และศิษย์เก่า  ซึ่งมีผลการประเมินฯ ดังนี้

• ผลการประเมินตามเกณฑ์ สกอ. (23 KPI)             =        4.83 
• ผลการประเมินตามเกณฑ์ สมศ (ตัวบ่งชี้ 1-11)       =        4.34

ทั้งนี้คณะกรรมการได้ให้ข้อเสนอแนะที่เป็นประโยชน์ต่อการพัฒนาการดำเนินงานของคณะต่อไป