คณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี มีพันธกิจด้านการวิจัย ที่มุ่งเน้นการส่งเสริมและพัฒนางานวิจัยที่มีคุณภาพ โดยเน้นการสร้างองค์ความรู้ใหม่ การวิจัยเชิงประยุกต์ และการบูรณาการข้ามศาสตร์ เพื่อให้ตอบสนองต่อความต้องการชองสังคม ประเทศ และภูมิภาค การส่งเสริมการวิจัยที่เชื่อมโยงกับการเรียนการสอนและบริการวิชาการ เพื่อให้ัการวิจัยเป็นรากฐานของการเรียนรู้และการพัฒนาอย่างยั่งยืน ตลอดจนงการสร้างความร่วมมือด้านการวิจัยกับเครือข่ายทั้งในและต่างประเทศ เพื่อแลกเปลี่ยนองค์ความรู้ เพิ่มศักยภาพการแข่งขัน และขยายผลการวิจัยสู่สากล